Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR78Q96P69 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms