Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5RAP3Q96JB5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms