Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC1Q96C34 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC1Q96C34 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms