Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms