Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms