Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED13LQ71F56 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13LQ71F56 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms