Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR88Q6ZMY6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR88Q6ZMY6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms