Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H3F3CQ6NXT2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms