Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms