Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms