Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms