Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms