Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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