Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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