Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms