Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms