Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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