Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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