Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms