Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms