Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms