Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms