Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms