Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LUMP51884 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LUMP51884 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LUMP51884 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms