Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SMARCA2P51531 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA2P51531 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms