Protein–RNA interactions for Protein: P49747

COMP, Cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMPP49747 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COMPP49747 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COMPP49747 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COMPP49747 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COMPP49747 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COMPP49747 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COMPP49747 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms