Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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