Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNT2P45379 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT2P45379 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms