Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYKP34925 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYKP34925 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYKP34925 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYKP34925 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms