Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK11BP21127 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK11BP21127 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms