Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ITGA4P13612 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA4P13612 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms