Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL2P13500 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL2P13500 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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