Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXD8P13378 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms