Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SERF1AO75920 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SERF1AO75920 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms