Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms