Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID2O43424 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID2O43424 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID2O43424 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID2O43424 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms