Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTIFO43310 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTIFO43310 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CTIFO43310 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTIFO43310 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTIFO43310 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTIFO43310 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTIFO43310 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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