Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms