Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms