Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC3Q9UQE7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms