Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF346Q9UL40 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms