Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 164.4
UTP3Q9NQZ2 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 321.28■■□□□ 13e-6■■■■■ 164.3
UTP3Q9NQZ2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 164.3
UTP3Q9NQZ2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 164.3
UTP3Q9NQZ2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 164.3
UTP3Q9NQZ2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 164.3
UTP3Q9NQZ2 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-9■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-207ENST00000512465 4663 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-209ENST00000513898 4202 ntTSL 1 (best)9.93□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 164.2
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 220.91■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 164.1
UTP3Q9NQZ2 TPP2-201ENST00000376052 5447 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 CCDC88C-209ENST00000554872 1165 ntTSL 416.95■□□□□ 0.34e-8■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 CCDC88C-206ENST00000553437 550 ntTSL 210.94□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 HERC4-206ENST00000427635 6391 ntTSL 27.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 164
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-217ENST00000613466 1674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-204ENST00000502651 867 ntTSL 211□□□□□ -0.659e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.659e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-211ENST00000510270 963 ntTSL 310.68□□□□□ -0.79e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-218ENST00000641499 1538 nt10.67□□□□□ -0.79e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-212ENST00000511466 687 ntTSL 210.64□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-215ENST00000514390 794 ntTSL 310.57□□□□□ -0.729e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-209ENST00000507656 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.759e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.89e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-207ENST00000506851 471 ntTSL 39.3□□□□□ -0.929e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC10-214ENST00000513054 689 ntTSL 37.17□□□□□ -1.269e-8■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-205ENST00000477053 2859 ntTSL 218.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-203ENST00000473688 2941 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-201ENST00000383233 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-207ENST00000564551 586 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-209ENST00000565325 858 ntTSL 214.97□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 163.9
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 RRP15-202ENST00000491428 492 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 163.8
UTP3Q9NQZ2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.27□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 29.78□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.586e-9■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 212.24□□□□□ -0.456e-9■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.536e-9■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 28.29□□□□□ -1.086e-9■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 163.7
UTP3Q9NQZ2 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 420.13■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 163.6
UTP3Q9NQZ2 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC13.99□□□□□ -0.176e-9■■■■■ 163.5
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.225e-7■■■■■ 163.5
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 163.5
UTP3Q9NQZ2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 163.5
UTP3Q9NQZ2 MTMR9-204ENST00000530200 3503 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 163.5
UTP3Q9NQZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.135e-8■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-20■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 TTC37-210ENST00000512026 785 ntTSL 28.93□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 TTC37-208ENST00000508181 872 ntTSL 37.51□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 314.17□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 163.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-209ENST00000467287 649 ntTSL 412.77□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 163.3
UTP3Q9NQZ2 POGZ-219ENST00000533351 586 ntTSL 511.52□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 163.3
UTP3Q9NQZ2 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 163.3
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-218ENST00000635529 814 ntTSL 519.6■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 IRAK1-211ENST00000463031 357 ntTSL 317.11■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 512.09□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 57.11□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 163.2
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