Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPHNQ9NQX3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms