Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms