Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARD11Q9BXL7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms