Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUSC1Q9BVN2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUSC1Q9BVN2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms