Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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