Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PFDN5Q99471 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms