Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIN3AQ96ST3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms