Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms